המסוף מצוייד במערכות תפעוליות וטכנולוגיות מהמתקדמות בעולם הנמלים. מסוף הכרמל מתופעל חשמלית (ירוק) ע”י 6 עגורני גשר מסוג SPP המתנשאים לגובה של כ-75 מטר, מנופים אשר משרתים אוניות המאחסנות עד 18 מכולות לרוחב הסיפון.

עורף מסוף הכרמל מתופעל ע”י 12 עגורני שער חשמליים הנעים על פסים (RMG) שמתפעלים את מערך איחסון המכולות. עגורני השער מותאמים לאחסנה של 11 מכולות ברוחב ו-5 מכולות בגובה, בין רגלי העגורן.